旅行家1號搭載了三套機載電腦系統,包括Computer Command System (CCS)、Flight Data System (FDS)及Attitude and Articulation Control System (AACS)。由於記憶體極度有限,工程師必須編寫效率極高的軟體,程式碼通常只有幾千字機器碼。值得注意的是,部分軟體甚至在發射數十年後,仍需透過遠端更新。其設計理念著重於簡潔性、冗餘備份與保守的安全裕度,相較於現代飛船,它擁有較少的積體電路,也降低了軟體複雜性與對自主運算的依賴,許多關鍵系統都設有重複或備用裝置。