歐洲邊境管理新措施「入境/出境系統」（EES）已於今年四月全面啟用，旨在取代人工護照蓋章，改以電子化方式記錄非歐盟公民進出申根區的資訊。然而，旅遊業界近期示警，這項新制可能導致今年夏季旅客在邊境管制處面臨長達數小時的排隊，嚴重影響旅行計畫。

EES 系統從 2025 年 10 月開始逐步推行，並於 2026 年 4 月在所有申根區（由29個歐洲國家組成，這些國家之間取消了邊境管制）的外部邊境管制點全面運作。此系統要求來自美國、英國、加拿大等非歐盟國家的旅客，首次入境時需進行指紋掃描和臉部影像採集，並與標準護照檢查一同處理。歐洲機構最初表示，EES 是一項長期投資，旨在加強邊境安全並最終加速通關速度。

然而，自全面實施以來，多地已傳出通關等候時間長達三小時的報告。在法蘭克福和布魯塞爾等大型樞紐，以及義大利、葡萄牙和希臘的區域機場，非歐盟公民的處理時間顯著增加，造成兩到三小時的排隊時間。一些歐洲國家的媒體也報導，有旅客因邊境管制壅塞，即使提早數小時抵達機場，仍錯過班機。

部分國家已採取增派人手、增加生物辨識自助機台和改善旅客動線管理等措施。但也有報導指出，其他國家正面臨設備故障、軟體問題及舊航廈實體空間不足等困境，導致尖峰時段排隊緩慢。交通運輸業者，特別是往返英國與法國、比利時、荷蘭之間的巴士營運商，對在繁忙港口和隧道終端為大批旅客進行 EES 註冊的實際操作表示擔憂，預期可能導致長時間停滯。

英國等地的旅遊業者協會已發布指南，建議客戶為夏季邊境手續預留更多時間。業界通訊建議非歐盟旅客將申根區外部邊境視為潛在的瓶頸，並相應調整計畫。部分大型旅行社和航空公司已透過電子郵件提醒客戶關於 EES 註冊事宜，建議他們提早抵達機場。在某些情況下，即使是過去所需時間較短的短程航班，旅客也被鼓勵預留三到四小時來完成報到、安檢和邊境檢查。旅行規劃師也開始調整行程，例如增加在申根區樞紐的轉機時間、避免緊湊的非申根區和申根區航班轉乘，並在價格允許的情況下優先選擇直飛航班，以降低錯過轉機的風險。

歐洲官員表示，大規模系統變革初期出現混亂是正常現象，隨著基礎設施升級、問題解決以及更多旅客完成首次註冊，通關效率應會提高。理論上，一旦旅客的生物辨識資料建檔，後續通關速度會加快。然而，機場協會持續指出結構性問題，例如邊境管制人員長期短缺以及航廈佈局限制，這些因素預計將持續到夏季，無論軟體如何優化。對於旅遊業界而言，2026 年夏季將是這項新邊境制度的真實壓力測試。業界強調，大多數旅程仍會按計畫進行，但旅客應做好充分準備，尤其在尖峰時段，可能會遇到比以往更長的等候時間。