中國方面也未坐視不理。中國港口當局以「巴拿馬籍船舶」為目標,加強了檢查力度,並扣押部分船隻。根據聯邦海事委員會(U.S. Federal Maritime Commission, FMC)與亞太港口國控制協議數據顯示,三月份在中國港口被扣押的123艘船舶中,高達91艘(74%)懸掛巴拿馬旗。中華人民共和國外交部發言人林劍於4月29日回應,稱美國主導的聯合聲明是「扭曲事實的無稽之談」,強調船舶檢查是「符合規定的合法措施」,並批評美國「將港口問題政治化、安全化,並誹謗他國」。
雪梨大學美國研究中心副教授大衛·史密斯(David Smith)接受半島電視台採訪時指出,自荷莫茲海峽(Strait of Hormuz)關閉後,各國已意識到海運網路的脆弱性,若船隻和航運成為國際政治的籌碼,他不會感到意外。全球供應鏈管理平台Wakeo也指出,地緣政治衝突正決定巴拿馬運河的穩定性與成本,這將成為運往美國貨物的一大關鍵變數。巴拿馬運河承載全球5%的海上貿易量,其中超過70%的貨物與美國相關,其任何中斷都將對全球供應鏈造成顯著衝擊,進而間接影響依賴國際貿易的台灣經濟。