兩國在區域政策上多次出現分歧。例如在2025年末,沙烏地阿拉伯與阿拉伯聯合大公國曾在葉門問題上產生衝突,當時阿拉伯聯合大公國支持的分離主義團體「南方過渡委員會」,與沙烏地阿拉伯的合作夥伴立場相左。報導指出,沙烏地阿拉伯甚至曾對阿拉伯聯合大公國盟友及部署在穆卡拉港(Port of Mukalla)的軍事設備發動空襲。此外,以色列承認索馬利蘭(Somaliland)也加劇了沙烏地阿拉伯與阿拉伯聯合大公國之間的相互不信任。沙烏地阿拉伯認為阿拉伯聯合大公國默許以色列此舉會破壞區域穩定。兩國之間曾因這些議題爆發長達兩個月的社群媒體論戰及在華盛頓的公關戰。
面對伊朗的初期襲擊時,沙烏地王儲穆罕默德·本·薩勒曼(Mohamed bin Salman)與阿拉伯聯合大公國總統穆罕默德·本·扎耶德·阿勒納哈揚(Sheikh Mohamed bin Zayed Al Nahyan)曾展現團結。然而,隨著與伊朗的衝突持續,兩國立場逐漸分歧。沙烏地阿拉伯與巴基斯坦、埃及、土耳其等國傾向尋求外交解決方案,但阿拉伯聯合大公國則堅持在與伊朗達成的任何協議中,必須確保伊朗政權無法再次威脅其安全,認為沙烏地阿拉伯等國可能願意讓步。這種分歧侵蝕了兩國在2026年初建立的信任與團結。最終,阿拉伯聯合大公國評估與沙烏地阿拉伯雙邊關係的惡化,為其退出OPEC提供了契機。