根據指引,開發者必須明確指出導致疾病的分子異常,證明療法能夠精準鎖定該病因,並提供「靶點結合」的直接證據,即證明治療確實作用於目標基因、蛋白質或傳導路徑。此外,指引也強調利用「疾病自然史數據」(natural history data)的重要性,這類數據能協助臨床醫師記錄疾病在未經干預下的發展進程。
儘管該框架放寬了對統計數據量的要求,但 FDA 強調,這並不代表會降低藥物安全標準或製造規範,也無法保證藥物一定獲得核准,更不會承諾能夠完全治癒疾病。個人化療法仍面臨高昂成本、製造耗時以及長期追蹤評估不易等現實挑戰。該局的全面性框架顯示,罕見疾病治療的進展,有賴於將試驗設計與生物標誌物(biomarkers)適切地應用於小型患者群體。例如,在2025年,一項客製化體內基礎編輯療法便已成功用於治療一名罹患嚴重 CPS1 缺乏症的嬰兒,為此類治療開創先例。